วิธีการแบบมัลติโอมิกส์เผยให้เห็นปฏิสัมพันธ์ของไมโครไบโอมในลำไส้กับโฮสต์ในผู้ป่วยโรคไข้สมองอักเสบจากไขสันหลังอักเสบ/กลุ่มอาการอ่อนล้าเรื้อรัง สล็อต

นการศึกษาเมื่อเร็ว ๆ นี้ที่ตีพิมพ์ในCell Host & Microbeนักวิจัยได้ทำการตรวจสอบแบบ multi-omics ของปฏิกิริยาระหว่างไมโครไบโอมกับโฮสต์ในลำไส้และเมแทบอโลมิกในพลาสมาในผู้ป่วยโรคไข้สมองอักเสบกล้ามเนื้ออ่อนแรง/กลุ่มอาการอ่อนเพลียเรื้อรัง (ME/CFS)

การศึกษา: ปฏิสัมพันธ์ของ multi-"omics ของ gut microbiome-host อันตรกิริยาในผู้ป่วยโรคไขสันหลังอักเสบกล้ามเนื้ออ่อนแรง/โรคอ่อนเพลียเรื้อรังระยะสั้นและระยะยาว  เครดิตรูปภาพ: Vectorium/Shutterstock

การศึกษา: ปฏิสัมพันธ์ของ multi-"omics ของ gut microbiome-host อันตรกิริยาในผู้ป่วยโรคไขสันหลังอักเสบกล้ามเนื้ออ่อนแรง/โรคอ่อนเพลียเรื้อรังระยะสั้นและระยะยาว เครดิตรูปภาพ: Vectorium/Shutterstock

สำหรับการระบุลักษณะที่มีความละเอียดสูงของพารามิเตอร์ทั้งสองนี้ พวกเขายังได้รวมข้อมูลทางคลินิกและไลฟ์สไตล์ของผู้ป่วยทั้งหมดสำหรับการวิเคราะห์ความสัมพันธ์ พวกเขาทำโปรไฟล์ผู้ป่วย ME/CFS ระยะสั้นที่ได้รับการวินิจฉัยภายในสี่ปีที่ผ่านมา และผู้ป่วยระยะยาวที่ทุกข์ทรมานจาก ME/CFS นานกว่า 10 ปี เทียบกับกลุ่มควบคุมที่ดีต่อสุขภาพ การออกแบบกลุ่มประชากรนี้ช่วยให้นักวิจัยระบุคุณลักษณะของจุลินทรีย์และเมแทบอลิซึมที่แตกต่างกัน (ตัวบ่งชี้ทางชีวภาพ) ที่มีส่วนสนับสนุนความก้าวหน้าของ ME/CFS

พื้นหลัง

ME/CFS เป็นกลุ่มอาการที่ทำให้ร่างกายทรุดโทรมและซับซ้อน ซึ่งการศึกษาวิจัยได้รวบรวมความเข้าใจอย่างจำกัด ไม่ว่าจะเป็นการเปลี่ยนแปลงทางสรีรวิทยาที่เกี่ยวข้องกับกลุ่มอาการหรือกลไกทางชีววิทยาที่ควบคุม เนื่องจากการขาดแคลนข้อมูล นักวิทยาศาสตร์ยังคงต้องประสบความสำเร็จในการพัฒนาการรักษาเฉพาะ ME/CFS และเครื่องมือวินิจฉัยที่ใช้ไบโอมาร์คเกอร์ที่มีประสิทธิภาพ

เกี่ยวกับการศึกษา

ในการศึกษาครั้งนี้ นักวิจัยติดตามกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานที่การเปลี่ยนแปลงไมโครไบโอมของ ME/CFS อาจสะท้อนให้เห็นในเครื่องหมายเมตาบอลิซึมที่ไหลเวียนอยู่ในเลือด ซึ่งในทางกลับกัน ทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงมากขึ้นในสรีรวิทยาของโฮสต์ พวกเขาลงทะเบียนผู้ป่วย ME/CFS 149 ราย โดย 74, 75 และ 79 รายอยู่ในกลุ่มควบคุมระยะสั้น ระยะยาว และมีสุขภาพดีตามลำดับ พวกเขาติดตามผลเป็นเวลาหนึ่งปีกับผู้ป่วย ME/CFS 107 ราย และกลุ่มควบคุมสุขภาพ 59 ราย

ผู้เข้าร่วมเหล่านี้ปฏิบัติตามเกณฑ์การคัดเลือกสามประการ:

เกณฑ์การวิจัยกลุ่มอาการเหนื่อยล้าเรื้อรังระหว่างประเทศ

เกณฑ์การวินิจฉัยทางคลินิกของ IOM และ

เกณฑ์ฉันทามติของแคนาดา

พวกเขายังได้รวบรวมข้อมูลเกี่ยวกับประชากรและสุขภาพจากผู้เข้าร่วมทั้งหมด พวกเขาให้ข้อมูลเกี่ยวกับอายุ เพศ อาหารการกิน การศึกษา ประวัติทางการแพทย์ ฯลฯ ในทำนองเดียวกัน พวกเขาให้ข้อมูลเกี่ยวกับสุขภาพทั่วไป คุณภาพการนอนหลับ และสุขภาพทางเดินอาหาร (GI) ผ่านการกรอกแบบสอบถาม ในขณะที่ผู้เข้าร่วมเก็บตัวอย่างอุจจาระด้วยตนเอง ทีมได้เก็บตัวอย่างเลือด พวกเขาทำการจัดลำดับด้วยปืนลูกซองของ microbiome ในอุจจาระของผู้ป่วย ME/CFS และการควบคุมที่ดี

ทีมงานใช้ Over Representation Analysis (ORA) เป็นครั้งแรกในกลุ่มผู้ป่วยสองกลุ่มเทียบกับกลุ่มควบคุม จากนั้น พวกเขาทำการทดสอบผลรวมอันดับของ Wilcoxon กับเมแทบอไลต์ทั้งหมดและนับเมตาโบไลต์ที่แตกต่างกันอย่างมีนัยสำคัญในทุกเส้นทางย่อย ในทำนองเดียวกัน พวกเขาใช้การทดสอบ Fischer เพื่อระบุการกระจายของยีนที่แสดงมากเกินไปในทางเดิน พวกเขายังคำนวณความสัมพันธ์ระหว่างกลุ่มของสารเมแทบอไลต์ในทุกเส้นทางและเส้นทางย่อยที่เกี่ยวข้องด้วยการแบ่งชั้นตามระยะเวลาของโรค

eBook วิทยาภูมิคุ้มกัน

eBook โฟกัสอุตสาหกรรมภูมิคุ้มกันวิทยา

รวบรวมบทสัมภาษณ์ บทความ และข่าวสารชั้นนำในปีที่ผ่านมา

ดาวน์โหลดสำเนาฟรี

แบบจำลองการจำแนกประเภทแบบเบส์ช่วยระบุตัวบ่งชี้โรค ทั้งเมทาโกโนมิกและฟีโนไทป์ที่เริ่มมีอาการของโรคสำหรับกลุ่มควบคุมและผู้ป่วย มันอธิบายถึงความอุดมสมบูรณ์ของสายพันธุ์จุลินทรีย์ทำให้ปริมาณยีน Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) เป็นปกติและโปรไฟล์เมแทบอไลต์ โมเดล multi-omics ที่รวมทุกอย่างพร้อมคุณสมบัติ 10 ประการที่รวบรวมจากโมเดลการจำแนกแต่ละประเภท